Mol Cell:张锋再造；还有组合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，康奈尔大学和耶鲁大学Broad研究工作所传来出乎意料：Pardis C. Sabeti、张锋等研究小组联合开发出一种新型的抗病原该系统。世界上有许多常见的致命病原体都是基于单链RNA的病原，像是乙型肝炎病原、寨卡病原和乙型肝炎。该该系统在CRISPR Cas13高效率的基础上再次升级，可主要用途扫描和冲击生命体细胞核中会有着单链RNA的病原。该研究工作出版在《Molecular Cell》Magazine上。CRISPR该系统为抗病原方法助长新时代此前，张锋小组的研究工作部门凭借着CRISPR/Cas9该系统为加固免疫该系统抵御病原侵略助长新的希望。然而，侵略生命体的病原极为多变，即使是在同一质种内，也能大大生存环境。因此我们需要更为灵巧的预防病原应用软件。为了探索新的抗病原作法，研究工作部门将慢慢地眼见了CRISPR Cas13该系统，Cas13底质可以天然地靶向菌株中会的病原RNA。它可以对蛋白质开展编程，从病原胶体中会去除特定的核糖核酸序列。尽管CRISPR Cas13该系统仍然实际上一些局限性，但是该方法在的实验室中会易于转换，并且此前张锋小组的研究工作部门在哺乳动质细胞核中会仍未开展了充分的实验证明。研究工作部门开发了一种来由CARVER的新型应用软件，它能将Cas13介导的病原RNA裂解与基于Cas13的并能诊断检测器混合上去，适用特定的高灵敏度底质报告分子结构破关（SHERLOCK）应用软件，扫描消灭基于RNA的病原。创立；也的该系统研究工作部门首先检验了350多个生命体之外病原（HAV）真核生质，以认定Cas13可以必需靶向的病原RNA序列。他们主要寻找的是既不易变异，又最有似乎在整块后禁用病原的片断。病原真核生质中会潜在的Cas13尽可能碱基耶鲁大学Cameron Sabeti的实验室的研究员Myhrvold博士说明：“理论上，你可以编程Cas13来攻击病原的任何其余部分。但是质种实质上和质种之间都有巨大的多样性，随着病原的进化，大其余部分真核生质都暴发了进一步的叠加。如果你不小心，你似乎会追求最终没必需果的尽可能。”然后，他们通过计算出来系统性核酸资料，以具体数百种病原质种中会的数千个潜在碱基，这些碱基似乎是Cas13的必需靶标。接下来，研究工作部门所设计了该该系统的Cas13指导RNA。新编程的Cas13在受到感染了抗原性脉络膜高血压病原（LCMV）、甲型乙型肝炎（IAV）和白点性口炎病原（VSV）的生命体细胞核中会开展了实验测试。将Cas13引进样品后24不间断，研究工作部门观察到人才培养质中会病原RNA的素质增大了40倍。随后，研究工作部门检查了Cas1抑制病原受到感染性的潜能。研究工作资料揭示：病原暴露后八不间断，Cas13将乙型肝炎的受到感染力增大了300倍以上。最终，该小组适用SHERLOCK扫描高效率来数据处理校准Cas13靶向后的病原RNA素质。该扫描该系统提供了有关治果的并能该系统以及有关特定病原变异的资讯。简短对于病原受到感染的疗程，虽然仍未核准了90多种抗病质，但它们并不需要疗程9种疾病。总体而言，只有16种病原有着FDA核准的疫苗。因此，找到行之必需的抗病原方法显得尤为重要。该研究工作的第一作者 Catherine Freije 说明：“Cas13可以是一种研究工作来进行，来探索生命体细胞核中会病原病理学的许多方面，它也似乎是一种流行病学来进行，主要用途诊断样本，疗程病原受到感染，并衡量疗程的必需性——所有这些都能让CARVER在新的或耐药性病原出现时进一步适应和应对。”原始来历:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]