Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地手绘出人类肠道的微生态系统目录!

2021-12-27 01:42:31 来源:
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近日,一项刊登在国际上时代周刊Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的近期之前,来自欧洲分子生物学数据集分析室等私人机构的科学家们通过数据集分析将人类十二指肠有机物2人之前所有已知的寄生虫基因2人编著变成了一个大型的文档,从而就能鼓励数据集分析医护人员深入即使寄生虫基因和酶之间的关联,以及其对人类身心健康的影响。

寄生虫遍布人体内皆,其必须产生氨基酸来影响本机消化、身心健康和对性疾病的易感性,其如此尤其以至于人体有机物2人变成员的数量要比人体细胞还要多,之外寄生虫、真菌和其它有机物;为了理解寄生虫在人类生物学之前所扮演的关键反派,科学家们通常会在数据集分析室之前受控并对其培养显现出来,随后在对寄生虫透过DNA基因2人,然而现有很多寄生虫还无法在数据集分析室的生态之前被培养显现出来产卵。

为了拿到这些寄生虫的相关信息,数据集分析医护人员采取了另皆一种方法,他们从生态之前(比如十二指肠)获取单一样本,随后在对整个样本之前的DNA透过基因2人,然后利用计算机方法对来自单一样本之前的数千种物种的个体基因2人透过重建,这种方法被称之为宏基因2人学技术开发,该技术开发能作为一种替代方法对单个物种的DNA透过受控和基因2人。

数据集分析者Rob Finn说明,去年之外我们在内的三个法理团队重建了变据称个十二指肠有机物2人基因2人,而较大的问题就是这些团队所得到的结果是否有着可比性,以及是否能将这些结果编著变成为一个非常全面的指南。现有数据集分析医护人员仍然从人类十二指肠之前大约4600种寄生虫群落之前编著了20万个基因2人和1.7亿个氨基酸序列,这种新型的文档(统一的人类胃十二指肠基因2人集合和统一的胃十二指肠氨基酸第一版)揭示了本机十二指肠的巨大多样性,并为进一步透过十二指肠有机物2人数据集分析铺平了道路。

数据集分析者绘制显现出的这个巨大的第一版是有机物2人数据集分析的一个历史性,将会或将能为科学家们提供非常宝贵的人力来数据集分析人类十二指肠自然生态之前每一种寄生虫所扮演的关键反派。这项数据集分析表明,大约70%被检测到的寄生虫从而在数据集分析室之前被变失败培养显现出来过,而其在体内的活性仍然未知,而这类寄生虫之前较大的社会阶层就是Comantemales;数据集分析者说明,看到Comantemales如此尤其真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对十二指肠之前的寄生虫知之甚少,我希望这个第一版能鼓励生物信息学家和生物学家在将会几年补足这一知识空白。

该文档/第一版获取的所有数据集都能在该网站人力Mgnify之前拿到,其能鼓励科学家们分析有机物的基因2人数据集并且与当前的文档透过对比;随着世界性数据集分析团队不断发布新闻新的文档,该第一版可能扩大到之外其它本机部位的有机物2人,比如黏膜或口腔内外等部位。最后数据集分析者说明,这一第一版的编著将会或为有机物学家和用药医护人员提供比较丰富的人力,然而数据集分析医护人员可能在南美、亚洲地区和乌干达等近现代不足的地区注意到更为多新的寄生虫物种,现有数据集分析医护人员非常清楚不同老年人之前寄生虫多样性的相似之处和变化情况。

原始显现出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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