Cell | 建立人类树突状细胞与辅助性T细胞作用力模型

细胞内-细胞内电磁力异常繁复，涵盖大量水分子与接收机通道，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自法国巴黎PSL深入研究大学的Vassili Soumelis制作组于在Cell时尚杂志上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的文章，设立了试验中与理论数学方法相结合的深入研究工具，试验中上，在胺基酸高度扫描了细胞内所分泌物的细胞内因子与应激反应；理论数学方法上，设立了接收机输入输入之彼此间的联系和电磁力关连。原作者以进化树突锥形细胞内（Dendritic cell，通称DC）与这两项T细胞内（T Helper cell，通称Th）之彼此间的电磁力为深入研究取向，比对了36由此可知DC系统性的接收机水分子和17种Th分泌物的细胞内因子，并仅靠这些数据库设立一个系统，演算出56种不太也许被试验中断定的细胞内关连等，与此同时，还表明出290种也许关连，并断定了IL-12p70可以通过IL-1接收机通道诱发17型这两项T细胞内（通称Th17）。首先，原作者采集了进化单核细胞内举由此可知的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类细胞内，并诱发24全程。所引入的诱发接收机主要构成三大类合计14种。第一种：内源接收机水分子，还包括趋化因子beta（interferon β，通称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll所发特异性的配基，还包括Toll4特异性的激动剂脂多糖（ lipopolysaccharide，通称LPS），Toll1/2特异性激动剂PAM3CSK4，Dectin1激动剂Curdlan，Toll2/Dectin1激动剂 zymosan，Toll7/8特异性激动剂R848，Toll3特异性激动剂 poly(I：C) 和NLRP3坏死小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，还包括高温灭活的Candida albicans （通称HKCA），李斯特菌（Listeria monocytogenes，通称HKLM），Staphylococcus aureus （通称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （通称HKSP）和流感病毒（influenza virus，通称flu）。每一次，原作者通过流式细胞内术等工具，扫描了36种DC系统性水分子的隐含状况，其中，29种东南面细胞内表层，7种东南面细胞内分泌物上清之中。%-，除了一些已知的DC细胞内自发之外，原作者还有了一些取而代之可知：（1）zymosan诱发的MoDCs 隐含高高度的CD54 和PVR；（2）流感病毒诱发的MoDCs可以诱发ICOSL；（3）LPS诱发的MoDCs 可以诱发高高度的CD30L和CD83。再下来，原作者将这些诱发过的DC与T细胞内浙大6天，随后扫描Th的增殖效率以及17种Th系统性细胞内因子的隐含分泌物状况。有趣的是，原作者将Th和DC的表现相互更为，可知，这二者之彼此间并不假定一一对应的关连，也就是说，两种诱发物对DC产生的敏感度类似，但是，这两种诱发物所处理的DC与T细胞内浙大便，产生的敏感度很可以截然不同。接着，原作者引入分布式计算的工具，以上述试验中数据库设立数学方法。简单来说，原作者总合DC输入的36种接收机水分子和Th输入的17种效应水分子，将两两之彼此间的关连简化为“反之亦然管控”和“对人管控”两种，并且，还转为数据库库系统和已发表典籍中的信息，设立了繁复的接收机管控网络。由此可知如，通过这一数学方法，原作者可知， IL-10的对人管控水分子还包括OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而反之亦然管控水分子还包括Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这所发，给予DC不同的诱发接收机，原作者就可以可知Th自发细胞内IL-10的隐含分泌物状况。就此，原作者利用这所发数学方法，试绘出表明并断定取而代之细胞内关连等。通过设立的数学方法，原作者可知，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2联合分泌物时，极端于管控IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 联合浮现时，则更极端于管控IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的隐含高度都相更为降低。这些结果说明，IL-12参与Th17的诱发分化。为了进一步深入探讨IL-12诱发Th17的有助于，原作者引入体外诱发Th的数学方法，可知，IL-12并不能直接诱发Th17，但是，同时转为IL-1和IL-12，Th17就诱发出来了。这是一篇试验中与理论数学方法相结合的优秀作品。试验中结果与计算数学数学方法相互支持，相互个人兴趣，相辅相成。如下绘出所示，试验中以外引入了密切关联两以外数据库，一是何种诱发下DC细胞内的自发，二是自发后的DC对T细胞内的作用。理论数学方法以外以DC和T细胞内的输入细胞内因子为核心，设立了细胞内因子之彼此间的反之亦然和对人管控网络数学方法。通过这一数学方法，原作者预测出一些取而代之细胞内彼此间关连等，就此再用试验中断定这些关连是否属实。这篇文章的；还有有两处，一是设立和试验中理论数学方法相结合深入研究的范本，二是文章中提供的诸多细胞内管控信息以供深入研究参考。原始出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.